Téma: Urologická onkológia

Prvé komplexné molekulovogenetické sekvenovanie (NGS) uroteliálneho karcinómu močového mechúra v slovenskej populácii

Lucia Neuschlová, Zuzana Varchulová Nováková, Štefan Harsányi, Robert Petrovič, Branislav Trebatický, Pavel Babál, Luboš Danišovič, Stanislav Žiaran

Cieľ: Uroteliálny karcinóm močového mechúra (UBC) je heterogénne nádorové ochorenie, ktorého genetické pozadie zásadne ovplyvňuje prognózu a odpoveď na liečbu. Cieľom štúdie bolo analyzovať mutačný stav vybraných génov spojených s UBC u slovenských pacientov pomocou sekvenovania novej generácie (NGS, next-generation sequencing).
Metodika: Do štúdie bolo zaradených 36 pacientov s histologicky potvrdeným UBC. Vyšetrené boli nádorové tkanivá a zodpovedajúce vzorky periférnej krvi. Cielené sekvenovanie panelu 25 génov typicky alterovaných v UBC bolo realizované na platforme Illumina MiniSeq. Varianty boli hodnotené podľa kritérií ACMG a TIER klasifikácie.
Výsledky: Patogénne alebo pravdepodobne patogénne varianty boli identifikované u 25 z 36 pacientov (69,4 %). Najčastejšie mutácie sa vyskytli v génoch FGFR3 (47,2 %), TSC1 (16,7 %), PIK3CA (16,7 %) a TP53 (13,9 %). Mutácie FGFR3 korelovali s neinvazívnymi a lepšie diferencovanými karcinómami (p < 0,05), zatiaľ čo mutácie TP53 boli spojené s invazívnymi a horšie diferencovanými karcinómami (p < 0,05). Zaznamenaných bolo sedem zriedkavých variantov v génoch KDM6A, ARID1A, TSC1 a CDKN1A, ktoré doposiaľ neboli opísané v súvislosti s UBC.
Záver: Výsledky potvrdzujú medzinárodne pozorované trendy v mutačnom spektre UBC a prinášajú nové údaje o výskyte vzácnych variantov v slovenskej populácii. Molekulové profilovanie pomocou NGS predstavuje perspektívny diagnostický nástroj pre personalizovanú liečbu pacientov s UBC.
 

First comprehensive molecular genetic sequencing (NGS) of urothelial bladder carcinoma in the Slovak population
Objective: Urothelial bladder carcinoma (UBC) is a heterogeneous tumour disease, the genetic background of which fundamentally affects the prognosis and response to treatment. The study aimed to analyse the mutational status of selected genes associated with UBC in Slovak patients using next-generation sequencing (NGS).
Methods: 36 patients with histologically confirmed UBC were included in the study. Tumour tissues and corresponding peripheral blood samples were examined. Targeted sequencing of a panel of 25 genes typically altered in UBC was performed on the Illumina MiniSeq platform. Variants were assessed according to ACMG and TIER classification criteria.
Results: Pathogenic or likely pathogenic variants were identified in 25 of 36 patients (69.4%). The most frequent mutations occurred in the genes FGFR3 (47.2%), TSC1 (16.7%), PIK3CA (16.7%), and TP53 (13.9%). FGFR3 mutations were correlated with non-invasive, better-differentiated carcinomas (p < 0.05), while TP53 mutations were associated with invasive, worse-differentiated carcinomas (p < 0.05). Seven rare variants were identified in the genes KDM6A, ARID1A, TSC1, and CDKN1A, none of which have been described in connection with UBC.
Conclusion: The results confirm international trends in the UBC mutation spectrum and provide new data on the occurrence of rare variants in the Slovak population. Molecular profiling using NGS represents a promising diagnostic tool for personalised treatment of patients with UBC.
Keywords: urothelial carcinoma, FGFR3, TP53, somatic mutations, NGS, molecular profiling
 

Ročník 2025  Témy časopisu Klinická urológia 3 / 2025

PREDSEDA
prof. MUDr. Ján Kliment, CSc.

ČLENOVIA
MUDr. Vladimír Baláž, PhD.
prof. MUDr. Ján Breza, DrSc.
prof. MUDr. Peter Bujdák, PhD.
doc. MUDr. Pavol Dubinský, PhD.
prof. MUDr. Tomáš Hanuš, DrSc.
prof. MUDr. Milan Hora, Ph.D., MBA
doc. MUDr. Ladislav Jarolím, CSc.
MUDr. Ľubomír Lachváč, PhD.
doc. MUDr. Ján Ľupták, PhD.
doc. MUDr. Ivan Minčík, PhD.
prof. MUDr. Vincent Nagy, PhD., MPH
prof. MUDr. Dalibor Ondruš, DrSc.
prof. MUDr. Dalibor Pacík, CSc.
prof. MUDr. Vladimír Študent, Ph.D.
prof. MUDr. Ján Švihra, PhD.
prof. MUDr. Ladislav Valanský, PhD.
doc. MUDr. František Záťura, Ph.D.
prof. MUDr. Peter Zvara, PhD.

RECENZENTI
MUDr. Vladimír Baláž, PhD.
prof. MUDr. Ján Breza, DrSc.
prof. MUDr. Peter Bujdák, PhD.
MUDr. Boris Eliáš, PhD.
MUDr. Ján Kliment, PhD., FEBU
doc. MUDr. Ján Krhut, Ph.D.
doc. MUDr. Ján Ľupták, PhD.
prof. MUDr. Vincent Nagy, PhD., MPH
prof. MUDr. Dalibor Ondruš, DrSc.
prof. MUDr. Vladimír Študent, Ph.D.
prof. MUDr. Ján Švihra, PhD.
prof. MUDr. Ladislav Valanský, PhD.

ODBORNÝ REDAKTOR
prof. MUDr. Ján Švihra, PhD.

REDAKTORKA
Ing. Danica Paulenová
e-mail: paulenova@amedi.sk

GRAFICKÁ ÚPRAVA
Ing. Lukrecia Schiller
e-mail: dtp@amedi.sk

MANAŽÉR MARKETINGU, INZERCIE A PODUJATÍ
Ing. Dana Chodasová
mobil: 0904 272 258
e-mail: chodasova@amedi.sk

EKONOMIKA A PREDPLATNÉ
Ing. Martina Ďurčovič
mobil: 0911 117 949
e-mail: durcovic@amedi.sk

JAZYKOVÁ KOREKTÚRA
Mgr. Eva Doktorová

KOREKTÚRA ANGLICKÝCH TEXTOV
Ing. Janka Bábelová, PhD.

RUBRIKY

Najnovšie poznatky o etiológii, patogenéze, diagnostike a terapii chorôb a skupín ochorení.
Maximálny rozsah je 7 strán (veľkosť písma 12, typ písma ARIAL, TIMES, riadkovanie 1,5). V prípade spracovávania obsiahlejšej tematiky je možné po dohode s redakciou rozdeliť príspevok do niekoľkých častí.

Pôvodné práce
Maximálny rozsah je 10 strán.
Členenie:

Algoritmy diagnostiky a terapie
Diagnostika a terapia spracovaná v tabuľkách a schémach, s minimálnym textom, s dôrazom na stručnosť a prehľadnosť.

Kazuistika
Maximálny rozsah je 3 strany. Členenie: úvod, vlastný prípad, záver, literatúra.

Rôzne
Reakcie na prehľadné články, novinky v oblasti diagnostiky, terapie, výsledky štúdií (max. 3 strany) , správy z odb. podujatí, abstrakty z vedeckej práce publikovanej v zahraničnej tlači, nie staršej ako 1 rok. Rozsah max. 1 strana . Uveďte názov práce v slovenčine/čestine, autorov, pracovisko, ďalej názov práce v angličtine s úplnou citáciou.

SPRACOVANIE RUKOPISU:
Príspevok píšte na počítači v niektorom z bežných textových editorov.
– píšte na celú šírku riadkov (ENTER priezviská až na konci odstavcov)
– neupravujte text do stĺpcov – nezalamujte, tabuľky čísla umiestnite na záver práce
– rozlišujte dôsledné 1, 0 a písmená l, O
– zátvorky sú vždy okrúhle štruktúry ( ) – skratky
vždy vysvetlené pri ich

NÁLEŽITOSTI RUKOPIZOV : 1. 2 adresy autora . 2. Materiál a metódy (neuvádzať názov pracoviska) 3. Výsledky 4. Záver 5. Kľúčové slová – v. rozsah 3-6. Píste v 1. alebo 3. osobe jednotného alebo množného čísla (zjednotiť podľa typu článku). 3. Anglický preklad: názov práce, súhrn, kľúčové slová 4. Vlastný text Ak vkladáte do dokumentu, pošlite tiež ich originálne súbory vo formáte „jpg“, grafy vytvárajte v programe Excel a posielajte ich originálne súbory. Pri posielaní fotodokumentácie poštou posielajte, prosím, len kvalitné originály. Každú predlohu označte číslom, pod ktorým je zmienená v texte. Text píšte v 1. alebo 3. jednotnej osobe alebo množnému číslu (zjednotiť podľa typu článku). Vo vlastnom texte nepoužívať zvýraznenie textu napr. podčiarknutý text, hrubé písmo, s výnimkou nadpisov, odvolávok na obrázky, tabuľky, grafy. 5. Literatúra Citácie sú očíslované chronologicky hrubým písmom, odkazy v texte sú uvádzané číslo citácie v okrúhlych zátvorkách. Uveďte maximálne 30 citácií. 6. Dôraz sa kladie na citácie prác uverejnených v Klinickej urológii. 7. Citácie Citácia znamená vo všeobecnosti: meno autora (autorov), názov práce, názov časopisu, rok vydania, ročník, strany. Príklady citácií: 1. Shaheen NJ, Crosby NA, Bozymski EM. Je v hlásení rizika rakoviny v Barrettovom pažeráku skreslená publikácia? Gastroenterology 2000; 119: 333 – 338. 2.




















Stenestrand U, Wallentin L. Švédsky register srdcovej intenzívnej starostlivosti (RIKS-HIA): Včasná liečba statínmi po akútnom infarkte myokardu a 1-ročné prežívanie. JAMA 2001; 285: 430-436.
3. Študijná skupina LIPID. Prevencia kardiovaskulárnych príhod a smrti pravastatínom u pacientov s koronárnou chorobou a širokým rozsahom počiatočného hladín cholesterolu. N Engl J Med 1998; 339: 1349-1357.
4. Jurkovičová O, Spitzerová H, Cagáň S. Komorové arytmie a náhla srdcová smrť pri akútnom infarkte myokardu. Bratislava Lek Listy 1997; 98: 379-389.
5. Osborne BE. Elektrokardiogram potkana. In: Budden R, Detweiler DK, Zbinden G. Elektrokardiogram potkanov vo farmakológii a toxikológii. Oxford: Pergamon Press 1981: 15-27.

V citáciách za krstnými menami nie sú bodky. Za autormi nie je dvojbodka, ale bodka. Za rokom vydania je bodkočiarka, pred stranami je dvojbodka. Ak je autor jeden, dvaja alebo traja - treba uviesť všetkých. Pri viacerých ako troch autoroch uviesť prvých troch a „et al“, v slovenských a českých citáciách „a spol.“.

Všetci autori svojim podpisom deklarujú, že prídu na prípravu predloženej práce a súhlasia so spoluautorom.

AUTODIDAKTICKÝ TEST

kvôli prehľadňovaniu autodidaktických testov je potrebné k Vášmu článku dodať 4 ak nim po 4 odpovede s vyznačením jednej správnej odpovede, napr.:

Ktorý z faktorovvisí s rosaceou?
a. genetická predispozícia
b. škandinávsky pôvod
c. propionibacterium acnes
d. endoteliálny rastový faktor

Redakcia si musela robiť právo robiť drobné štylistické úpravy rukopisu. V prípade potreby skrátenia rukopisu bude vyžiadaný súhlas.

Všetky uverejnené príspevky sú honorované.

Vzhľadom k praktickému zameraniu časopisu Vás prosíme, aby bol príspevok napísaný zrozumiteľne, s dôrazom na praktické využitie podaných informácií v ambulantnej praxi urológov a príbuzných špecializácií.
Povinnou súčasťou každého rukopisu je vyhlásenie o konflikte záujmov, ako aj čestné vyhlásenie o tom, že práca nebola publikovaná v inom období.

Príspevky posielajte e-mailom na adresu: paulenova@amedi.sk